More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1121 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1121  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 431 aa  868    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2054  histidyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.526684  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1558  histidyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0108926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 419 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 423 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 419 aa  315  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 436 aa  312  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  45.33 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 420 aa  299  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 421 aa  296  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 430 aa  292  8e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 440 aa  289  6e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 429 aa  289  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 419 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.51 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 421 aa  279  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 414 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 411 aa  276  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 420 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 421 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 414 aa  270  5e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 423 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 423 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 426 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 445 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 419 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  39.1 
 
 		 422 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 417 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2188  histidyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 420 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 418 aa  259  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 420 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>