More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2054 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1558  histidyl-tRNA synthetase  76.89 
 
 
428 aa  654    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0108926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2054  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
430 aa  861    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.526684  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1121  histidyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
419 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
423 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
423 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
435 aa  317  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
423 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
421 aa  309  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
424 aa  308  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
423 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
421 aa  302  7.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
429 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
429 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
419 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
423 aa  298  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
424 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
417 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
429 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
424 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
417 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
430 aa  293  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
421 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  40 
 
 
423 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
420 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
420 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
429 aa  292  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
414 aa  288  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  38 
 
 
433 aa  286  5e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
420 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
441 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
415 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
420 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
419 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
418 aa  282  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
425 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
419 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
415 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
430 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
436 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
424 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
429 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
415 aa  279  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  39.91 
 
 
424 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
420 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
419 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
425 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
426 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
415 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
429 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
429 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
429 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
429 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
421 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
421 aa  276  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
418 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
418 aa  273  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
425 aa  272  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
446 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
423 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  42.25 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
428 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
419 aa  270  4e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
413 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  40.42 
 
 
422 aa  270  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
422 aa  269  7e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
424 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
411 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
419 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
419 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
429 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
430 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>