254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1318 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  100 
 
 
318 aa  611  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  56.11 
 
 
319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  42.72 
 
 
313 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  39.51 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  41.35 
 
 
319 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  35.09 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  34.15 
 
 
354 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  40.23 
 
 
319 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  34.66 
 
 
321 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  33.02 
 
 
327 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  37.96 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  32.68 
 
 
315 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  35.33 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  35.78 
 
 
350 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  34.85 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  34.85 
 
 
315 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  35.32 
 
 
320 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  32.94 
 
 
315 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  38.8 
 
 
316 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 
315 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  34.65 
 
 
319 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  34.15 
 
 
355 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  32.44 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  36.4 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  34.69 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.96 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  31.94 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  32.2 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 
328 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  31.35 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.97 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  31.35 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  31.35 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  33.05 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  34.67 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  34.82 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  32.35 
 
 
335 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
316 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  37.94 
 
 
316 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  36.25 
 
 
318 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  32.34 
 
 
358 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  33.47 
 
 
335 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.51 
 
 
316 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  32.16 
 
 
325 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  32.96 
 
 
342 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 
359 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  30.33 
 
 
354 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  31.3 
 
 
334 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  31.91 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.8 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  30.85 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  28.27 
 
 
351 aa  95.9  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  32.84 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  33.46 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  31.03 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  35.83 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  31.69 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  33 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  34.18 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  30.74 
 
 
344 aa  89  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  32.11 
 
 
317 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 
345 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29.55 
 
 
344 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  30.8 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  31.49 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  29.92 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.45 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.63 
 
 
340 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
339 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  31.8 
 
 
316 aa  87  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.22 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  29 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  33.96 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  28.24 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  33.19 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  30.47 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  29.19 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  29.64 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  33.05 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  33.33 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  35.56 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  28.24 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  28.83 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.32 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>