More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5704 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  61.57 
 
 
295 aa  328  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  54.8 
 
 
281 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  34.33 
 
 
272 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  32.58 
 
 
515 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32.54 
 
 
462 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  32.84 
 
 
475 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 
580 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  31.8 
 
 
546 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  36.9 
 
 
665 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  31.92 
 
 
521 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  36.79 
 
 
613 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  29.89 
 
 
522 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  38.91 
 
 
380 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  31.49 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  36.78 
 
 
546 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.52 
 
 
542 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.52 
 
 
542 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  35.07 
 
 
515 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.14 
 
 
542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  36.6 
 
 
513 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  33.2 
 
 
540 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  38.53 
 
 
216 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  29.57 
 
 
522 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 
519 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  31.71 
 
 
485 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  28.79 
 
 
522 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  33.05 
 
 
484 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  29.88 
 
 
522 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 
519 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  33.05 
 
 
484 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  31.32 
 
 
517 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  36.57 
 
 
215 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  29.88 
 
 
494 aa  96.7  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  34.53 
 
 
229 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  32.28 
 
 
537 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  26.95 
 
 
534 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.12 
 
 
553 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 
261 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  27.66 
 
 
518 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  28.95 
 
 
261 aa  92  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  26.61 
 
 
520 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  32.4 
 
 
534 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.06 
 
 
485 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  32.06 
 
 
534 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  34.67 
 
 
445 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  34.67 
 
 
445 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  35.78 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  31.71 
 
 
534 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  32.28 
 
 
534 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  35.47 
 
 
445 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 
504 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  32.4 
 
 
534 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.61 
 
 
521 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 
474 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.89 
 
 
343 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  32 
 
 
421 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  31.93 
 
 
537 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.08 
 
 
500 aa  90.1  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  29.18 
 
 
429 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  34.68 
 
 
214 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  32.48 
 
 
462 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  32.06 
 
 
534 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  30.8 
 
 
527 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.42 
 
 
523 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  32.51 
 
 
227 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  31.19 
 
 
500 aa  89  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 
523 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  26.8 
 
 
523 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  38 
 
 
230 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.76 
 
 
197 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 
500 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  31.23 
 
 
412 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  29.03 
 
 
505 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  26.8 
 
 
523 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.78 
 
 
545 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  32.59 
 
 
216 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  31.08 
 
 
511 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27.37 
 
 
522 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  30.9 
 
 
500 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.31 
 
 
489 aa  85.5  9e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 
188 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  30.77 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  33.49 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  29.13 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  32.94 
 
 
525 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  24.81 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  31.18 
 
 
522 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.34 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.2 
 
 
506 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  30.55 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  32.94 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3978  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  30.96 
 
 
558 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.24 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5600  DNA recombinase, putative, truncation  26.72 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
525 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.48 
 
 
539 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>