More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1328 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  77.08 
 
 
258 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  69.6 
 
 
268 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  69.2 
 
 
268 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  68.67 
 
 
260 aa  346  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  68.67 
 
 
260 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  66.8 
 
 
262 aa  340  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  66.27 
 
 
257 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  67.86 
 
 
258 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  65.96 
 
 
252 aa  324  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.4 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  66.81 
 
 
266 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  65.02 
 
 
259 aa  318  6e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  67.09 
 
 
270 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  66.94 
 
 
256 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  66.53 
 
 
256 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  65.38 
 
 
253 aa  315  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  65.38 
 
 
253 aa  315  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  66.53 
 
 
260 aa  310  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  45.49 
 
 
572 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  40.74 
 
 
568 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  41.22 
 
 
623 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 
629 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 
619 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 
619 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
594 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  42.56 
 
 
244 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
571 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
610 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 
619 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
610 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
606 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.91 
 
 
244 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 
573 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 
573 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
593 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  41.22 
 
 
256 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 
568 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
568 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
563 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.67 
 
 
567 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
585 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  41.98 
 
 
575 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.75 
 
 
552 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  41.56 
 
 
575 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  36.93 
 
 
563 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
606 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  38.71 
 
 
558 aa  165  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
572 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 
567 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
567 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  39.04 
 
 
250 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
244 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
242 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
535 aa  142  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
536 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 
252 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.98 
 
 
389 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.08 
 
 
397 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
386 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
399 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  28.24 
 
 
400 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.7 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 
220 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
344 aa  75.5  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  31.65 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
220 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.04 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.38 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  31.39 
 
 
883 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.95 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.9 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.56 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.86 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
336 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.51 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.75 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.28 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.05 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>