More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0032 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  64.11 
 
 		 539 aa  651    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  65.68 
 
 		 543 aa  701    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  69.26 
 
 		 555 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  63.23 
 
 		 542 aa  653    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  61.9 
 
 		 551 aa  644    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  72.78 
 
 		 547 aa  748    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  83.3 
 
 		 552 aa  845    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  63.04 
 
 		 542 aa  655    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  68.88 
 
 		 542 aa  743    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  100 
 
 		 551 aa  1095    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  63.04 
 
 		 543 aa  651    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  62.65 
 
 		 545 aa  650    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  83.55 
 
 		 552 aa  849    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  70.71 
 
 		 543 aa  745    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  59.14 
 
 		 557 aa  638    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  84.06 
 
 		 553 aa  845    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  61.97 
 
 		 558 aa  640    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  81.06 
 
 		 551 aa  842    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  60.69 
 
 		 559 aa  630  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  60.19 
 
 		 563 aa  625  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  60.93 
 
 		 543 aa  623  1e-177  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  62.47 
 
 		 500 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  57.2 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  61.35 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  59.08 
 
 		 553 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  57.77 
 
 		 560 aa  596  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  54.65 
 
 		 557 aa  578  1.0000000000000001e-163  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  55.6 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  52.63 
 
 		 554 aa  559  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  52.86 
 
 		 540 aa  557  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  51.4 
 
 		 554 aa  553  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  53.95 
 
 		 548 aa  550  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  53.27 
 
 		 553 aa  549  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  54.11 
 
 		 552 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  53.85 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  53.95 
 
 		 550 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  53.38 
 
 		 554 aa  538  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  53.93 
 
 		 529 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  51.4 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  53.64 
 
 		 541 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.74 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  50.63 
 
 		 559 aa  526  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.75 
 
 		 530 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  52.69 
 
 		 548 aa  522  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  52.19 
 
 		 554 aa  521  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  50 
 
 		 562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  51.42 
 
 		 558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  51.33 
 
 		 560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.43 
 
 		 527 aa  512  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.56 
 
 		 532 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.9 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  50.87 
 
 		 553 aa  498  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  47.19 
 
 		 558 aa  501  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  46 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  49.04 
 
 		 528 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.3 
 
 		 537 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.63 
 
 		 525 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.52 
 
 		 546 aa  452  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.23 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.58 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.23 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  41.01 
 
 		 538 aa  415  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  41.67 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  38.21 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  41.42 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  37.64 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  39.93 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  41.4 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  39.07 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  40.7 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  39.07 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  38.28 
 
 		 563 aa  364  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  39.08 
 
 		 542 aa  360  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  38.96 
 
 		 542 aa  358  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  38.14 
 
 		 577 aa  356  5.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  37.2 
 
 		 560 aa  355  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  37.57 
 
 		 570 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  37.57 
 
 		 536 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  39.52 
 
 		 533 aa  348  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  39.08 
 
 		 536 aa  347  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  37.94 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  38.25 
 
 		 553 aa  344  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.98 
 
 		 548 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.55 
 
 		 529 aa  340  5e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  36.78 
 
 		 558 aa  336  5.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  38.1 
 
 		 551 aa  332  9e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  38.04 
 
 		 548 aa  330  6e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  36.3 
 
 		 568 aa  326  9e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  36.03 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.52 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  34.36 
 
 		 523 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.75 
 
 		 552 aa  293  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.82 
 
 		 527 aa  290  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  33.01 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  35.05 
 
 		 534 aa  279  9e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  35.05 
 
 		 534 aa  279  9e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  32.5 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  35.85 
 
 		 526 aa  279  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  32.01 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  32.63 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>