98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_R0035 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 363 bp  720    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    87.5 
 
 		 358 bp  174  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  85.11 
 
 		 372 bp  143  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  84.97 
 
 		 303 bp  129  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  90.43 
 
 		 313 bp  115  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 297 bp  107  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    89.66 
 
 		 295 bp  101  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    89.66 
 
 		 303 bp  101  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  90.79 
 
 		 315 bp  95.6  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 213 bp  87.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 346 bp  75.8  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 307 bp  75.8  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  95.45 
 
 		 398 bp  71.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  86.36 
 
 		 301 bp  71.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  93.48 
 
 		 357 bp  67.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  93.48 
 
 		 356 bp  67.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 272 bp  65.9  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  85.23 
 
 		 328 bp  63.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 323 bp  61.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  97.14 
 
 		 276 bp  61.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0035  RNaseP RNA  94.74 
 
 		 378 bp  60  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 333 bp  60  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 328 bp  60  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 333 bp  60  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 327 bp  60  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    92.68 
 
 		 296 bp  58  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0020    92.68 
 
 		 296 bp  58  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  96.97 
 
 		 396 bp  58  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  96.97 
 
 		 288 bp  58  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0013  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 296 bp  58  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.297268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 332 bp  58  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0023    92.5 
 
 		 341 bp  56  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0216677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  84.21 
 
 		 326 bp  56  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 270 bp  56  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0085  RNA component of RNaseP  92.5 
 
 		 358 bp  56  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162846  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  92.5 
 
 		 298 bp  56  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0054  rnpB RNA  96.88 
 
 		 298 bp  56  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0048  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  54  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 324 bp  54  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 284 bp  54  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    94.29 
 
 		 330 bp  54  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 333 bp  54  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  96.77 
 
 		 338 bp  54  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 373 bp  54  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 315 bp  52  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  92.11 
 
 		 291 bp  52  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  89.13 
 
 		 298 bp  52  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  90.48 
 
 		 365 bp  52  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 366 bp  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  86.21 
 
 		 310 bp  52  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0003  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 327 bp  52  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0003  RNase P  93.94 
 
 		 331 bp  50.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 374 bp  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 354 bp  50.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 326 bp  50.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 386 bp  50.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 418 bp  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  93.94 
 
 		 349 bp  50.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 305 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 332 bp  48.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 341 bp  48.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 326 bp  48.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 339 bp  48.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 354 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 303 bp  48.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  96.43 
 
 		 340 bp  48.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0041  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 289 bp  48.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000296722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 348 bp  48.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 303 bp  48.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 308 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0074    90 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.301827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0039    96.43 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0063  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 299 bp  48.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  93.75 
 
 		 296 bp  48.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  93.75 
 
 		 302 bp  48.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rnpBVIMSS1309394  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.3 
 
 		 309 bp  46.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.371519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_DernpB1  sRNA  81.61 
 
 		 261 bp  46.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.573184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rnpBVIMSS1309388  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.3 
 
 		 307 bp  46.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 427 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0043  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 305 bp  46.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 332 bp  46.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 329 bp  46.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.3 
 
 		 333 bp  46.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rnpBVIMSS1309400  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.3 
 
 		 309 bp  46.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.930283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0006  RNAse P  81.61 
 
 		 304 bp  46.1  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.161973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  89.74 
 
 		 422 bp  46.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 312 bp  46.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 316 bp  46.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 364 bp  46.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 353 bp  46.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.3 
 
 		 390 bp  46.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0002  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 346 bp  46.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.269548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>