More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8725 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 332 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  85.54 
 
 		 354 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  79.45 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  82.53 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  81.02 
 
 		 332 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  81.56 
 
 		 332 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  80.12 
 
 		 332 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  55.59 
 
 		 350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  52.86 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  51.99 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  50.52 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  50.52 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 		 321 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 390 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  48.06 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  44.17 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  44.33 
 
 		 371 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 		 379 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.46 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  34.77 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  48.28 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  31.79 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.23 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.68 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  33.22 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  33.22 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  33.22 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  33.22 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  32.9 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33.22 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  27.76 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  32.69 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  32.69 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.95 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  29 
 
 		 278 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.91 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.29 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  27.64 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.29 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>