146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7485 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  100 
 
 		 490 aa  1001    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  66.67 
 
 		 476 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  70.11 
 
 		 488 aa  711    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  63.35 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  64.73 
 
 		 459 aa  616  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  56.57 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  56 
 
 		 473 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  49 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  44.22 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  45.36 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  42.65 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  43.99 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  42.73 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  41.98 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  42.83 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  41.34 
 
 		 482 aa  336  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  39.82 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  33.56 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  35.49 
 
 		 798 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  32.11 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  32.71 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  33.77 
 
 		 471 aa  229  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  32.06 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  35.14 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  31.2 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  32.34 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  34.98 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  34.2 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  33.04 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  31.56 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  30.31 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  33.19 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  31.08 
 
 		 493 aa  206  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  31.19 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  31.7 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  33.84 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  31.7 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  31.7 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  31.7 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  31.35 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  31.7 
 
 		 473 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  31.47 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  31.47 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  34.52 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  33.55 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  34 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  29.3 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  31.99 
 
 		 475 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  31.22 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  33.63 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  30.41 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  33.63 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  30.56 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  30.56 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  31.06 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  33.41 
 
 		 479 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  30.97 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  30.56 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  30.79 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.57 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  28.63 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  30.24 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  28.54 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  29.51 
 
 		 469 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  31.29 
 
 		 432 aa  180  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  29.16 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  29.37 
 
 		 474 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  30.04 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  30.44 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29.1 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  30.57 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  29.42 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  31.61 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  28.37 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  29.18 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  29.2 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.52 
 
 		 421 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  27.2 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  28.57 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  28.75 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  31.37 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  26.71 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  39.46 
 
 		 200 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  29.1 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  28.12 
 
 		 445 aa  126  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  28.67 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  26.46 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  27.58 
 
 		 435 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  26.69 
 
 		 431 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  28.32 
 
 		 449 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  25.79 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  26.27 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  36.97 
 
 		 222 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  25 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  28.8 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  22.13 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  22.13 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  25.69 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  24.04 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>