More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4258 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  100 
 
 		 445 aa  857    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  74.32 
 
 		 459 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  73.1 
 
 		 441 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  72.18 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  71.95 
 
 		 441 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  64.52 
 
 		 437 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  70.98 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  70.77 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  59.25 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  60.1 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  55.22 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  49.21 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  48.67 
 
 		 490 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  48.67 
 
 		 451 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  49.06 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  47.52 
 
 		 449 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.82 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  47.82 
 
 		 444 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  46.08 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  46.54 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  44.94 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  46.12 
 
 		 447 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  44.39 
 
 		 520 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  45.28 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  44.39 
 
 		 518 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.39 
 
 		 518 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  47.92 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  46.55 
 
 		 523 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  42.93 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.86 
 
 		 521 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  42.89 
 
 		 563 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  42.28 
 
 		 474 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  45.54 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  42.93 
 
 		 565 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  43.97 
 
 		 517 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  45.31 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  42.56 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  42.56 
 
 		 576 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  42.56 
 
 		 551 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  42.56 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  42.56 
 
 		 576 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  42.89 
 
 		 578 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  42.89 
 
 		 562 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  43.34 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  43.34 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.28 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  43 
 
 		 485 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  42.66 
 
 		 435 aa  259  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  41.71 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  43.68 
 
 		 485 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  41.85 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  40.84 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  40.56 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  40.18 
 
 		 456 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  41.65 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.18 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.51 
 
 		 454 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  40.14 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  37.39 
 
 		 522 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  39.49 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  37.67 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  29.32 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  32.73 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  33.52 
 
 		 569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.82 
 
 		 533 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.72 
 
 		 626 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  29.7 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.41 
 
 		 863 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.62 
 
 		 629 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.17 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.89 
 
 		 471 aa  103  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  30.9 
 
 		 669 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  28.34 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.67 
 
 		 620 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.41 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.3 
 
 		 615 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.7 
 
 		 859 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  31.67 
 
 		 627 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.81 
 
 		 584 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.65 
 
 		 614 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  33.15 
 
 		 606 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.47 
 
 		 897 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.82 
 
 		 627 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.51 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.37 
 
 		 563 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.17 
 
 		 863 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  26.68 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.06 
 
 		 519 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.16 
 
 		 862 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.29 
 
 		 597 aa  93.2  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.97 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  33.97 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.97 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.31 
 
 		 591 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.75 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.55 
 
 		 631 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.04 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  31.61 
 
 		 625 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>