More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0962 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0962  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 298 aa  567  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1674  methyltransferase type 11  70.41 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3585  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  38.17 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.41 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.88 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.81 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  51.79 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.72 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.8 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.65 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.4 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.43 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.5 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  38.82 
 
 		 461 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  38.82 
 
 		 461 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  30.28 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.13 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.65 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  42.34 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.65 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  34.3 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  43.21 
 
 		 502 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.3 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.47 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.3 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  42.34 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  32.35 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.09 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  34.83 
 
 		 783 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  38.74 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.03 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  37.07 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 367 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 1106 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  43.54 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  42.11 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.92 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  39.05 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  34.07 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 354 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0215  Methyltransferase type 12  35.56 
 
 		 233 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.647581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.33 
 
 		 442 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 349 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 2490 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.73 
 
 		 356 aa  52.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2332  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.19 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000815001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.94 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  32.11 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>