More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1674 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1674  methyltransferase type 11  100 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0962  Methyltransferase type 11  70.41 
 
 		 298 aa  318  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3585  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.23 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 2490 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  41.82 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.9 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  37.19 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.81 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.48 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.01 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  36.05 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  29.92 
 
 		 212 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.83 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  37.5 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  29.2 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.13 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  30 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  42.54 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  30.83 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.72 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.36 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  26.62 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.93 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  31.78 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  34.97 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  39.01 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  37.14 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  39.45 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  33.64 
 
 		 447 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  39.17 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.58 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  34.31 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.83 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  30.99 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  28.95 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 240 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 226 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  28.95 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  28.95 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.28 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  27.4 
 
 		 629 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.12 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.33 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  34.95 
 
 		 658 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.97 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  29.25 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.84 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  42.11 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  39 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>