81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2735 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
2490 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.56 
 
 
291 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  28.69 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.46 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  34.91 
 
 
329 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
367 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  27.05 
 
 
290 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  27.87 
 
 
290 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  27.05 
 
 
290 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
634 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  26 
 
 
290 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3841  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  22.54 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.29 
 
 
434 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.48 
 
 
420 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.93 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
266 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  31.31 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30 
 
 
220 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.45 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  35.92 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3428  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
254 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  35.92 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  29.08 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  27.52 
 
 
310 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
333 aa  45.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  29.9 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
337 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2130  methyltransferase type 12  32.5 
 
 
334 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 
311 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  28.57 
 
 
464 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5830  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.44 
 
 
405 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
447 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  30.69 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  27.22 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
624 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  27.87 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  29.59 
 
 
471 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.36 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.28 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
305 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  30.56 
 
 
330 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
305 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  25.36 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1674  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
293 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  28.72 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.58 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.03 
 
 
261 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.85 
 
 
395 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  25.77 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  24.69 
 
 
200 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.44 
 
 
420 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
263 aa  42  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  26.85 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
285 aa  42  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  27.18 
 
 
408 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
354 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
245 aa  42  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
259 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
252 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.56 
 
 
394 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 
261 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
231 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
244 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>