63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2080 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  100 
 
 
329 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  31.35 
 
 
330 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  34.71 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.39 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  34.51 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3585  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3428  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
254 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  34.91 
 
 
210 aa  52.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
2490 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  24.24 
 
 
244 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.72 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.08 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  22.01 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
214 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  29.79 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  35.92 
 
 
504 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
267 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 
232 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.49 
 
 
247 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.21 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  26.87 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.79 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.79 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  29.79 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.42 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.33 
 
 
232 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.79 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.43 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
535 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.5 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  22.29 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.77 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.37 
 
 
261 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
207 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.23 
 
 
241 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  32.64 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.31 
 
 
247 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.92 
 
 
413 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  29.79 
 
 
236 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
268 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1967  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
205 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247802  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  34.69 
 
 
341 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.5 
 
 
221 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 
238 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.46 
 
 
237 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.34 
 
 
232 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
247 aa  42.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31 
 
 
417 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.89 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  31.69 
 
 
236 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
218 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.33 
 
 
232 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.89 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  28.57 
 
 
269 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.33 
 
 
232 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>