152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3428 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3428  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.86 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.04 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.53 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  22.29 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.96 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 2490 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.72 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  33.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  33.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  33.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.02 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.86 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  35.58 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  27.33 
 
 		 447 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.42 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.44 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.49 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  29.31 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.17 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.78 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.07 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.73 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.11 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1451  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  31.65 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  22.16 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  46.94 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.29 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.73 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.18 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  26.29 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3397  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  25.15 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  27.32 
 
 		 341 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.09 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  32.5 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.52 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  23.23 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.25 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  43.48 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.58 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0468  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  30.38 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 885 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  31.75 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.12 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.87 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2709  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  42.37 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  26.83 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0369  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  40.48 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.44 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  38.89 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  42.55 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  32.14 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.33 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  31.34 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  31.37 
 
 		 471 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>