38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3397 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3397  methyltransferase type 12  100 
 
 
239 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
198 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  27.69 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
2112 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  32.95 
 
 
382 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3428  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.36 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  33.85 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  26.19 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 
746 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1230  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
180 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0668757  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  25 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3721  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  38.24 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  27.14 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  37.1 
 
 
470 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  26.27 
 
 
459 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  26.13 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  29.52 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
260 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  34.38 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  29.52 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  30.68 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.77 
 
 
666 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  29.52 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  29.52 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  29.52 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
288 aa  42  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  26.67 
 
 
176 aa  41.6  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>