More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0089 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  62.5 
 
 
647 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  84.54 
 
 
647 aa  1119    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  59.6 
 
 
652 aa  760    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  58.37 
 
 
658 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  69.2 
 
 
642 aa  920    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  64.87 
 
 
648 aa  834    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
647 aa  1318    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  42.79 
 
 
667 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  41.98 
 
 
664 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.09 
 
 
595 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.19 
 
 
598 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.44 
 
 
631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.82 
 
 
634 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.63 
 
 
624 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.09 
 
 
588 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.84 
 
 
568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.79 
 
 
723 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.93 
 
 
738 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.24 
 
 
622 aa  275  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.23 
 
 
622 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
597 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
626 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.84 
 
 
629 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  28.91 
 
 
603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  37.92 
 
 
408 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.64 
 
 
596 aa  230  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  79.14 
 
 
150 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.92 
 
 
643 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  27.41 
 
 
581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  37.5 
 
 
522 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  35.43 
 
 
531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  35.2 
 
 
525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  32.78 
 
 
502 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.92 
 
 
568 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  33.92 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  32.22 
 
 
499 aa  170  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  33.16 
 
 
518 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  25.7 
 
 
594 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  51.74 
 
 
553 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  45.45 
 
 
304 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  42.03 
 
 
312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  49.71 
 
 
310 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  23.84 
 
 
607 aa  148  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  53.8 
 
 
317 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  33.22 
 
 
515 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 
582 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
580 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  28.37 
 
 
508 aa  137  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  44.28 
 
 
306 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 
584 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  30.55 
 
 
510 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.25 
 
 
798 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  29.81 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
470 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  43.86 
 
 
327 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.76 
 
 
769 aa  127  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.66 
 
 
746 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  29.48 
 
 
543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.16 
 
 
757 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  28.11 
 
 
522 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  26.65 
 
 
784 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.49 
 
 
736 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  29.11 
 
 
686 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
644 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  26 
 
 
521 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.85 
 
 
737 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  29.86 
 
 
636 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.96 
 
 
521 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 
821 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  30.37 
 
 
646 aa  94.4  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  32.8 
 
 
605 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  30.85 
 
 
608 aa  90.9  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  25.83 
 
 
527 aa  90.5  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  25.07 
 
 
375 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
449 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
449 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
449 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  25.82 
 
 
531 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  28.75 
 
 
606 aa  77.4  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  39.17 
 
 
680 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.8 
 
 
878 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  26.01 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  29.5 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.51 
 
 
1149 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  29.78 
 
 
600 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  36.14 
 
 
295 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.2 
 
 
810 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.08 
 
 
878 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.82 
 
 
822 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  24.8 
 
 
1037 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
878 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  26.19 
 
 
1392 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 
1151 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
279 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
1198 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 
1151 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
279 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>