More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2313 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2313  type II secretion system protein E  100 
 
 
316 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  43.23 
 
 
888 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  42.75 
 
 
548 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.7 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.15 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  41.24 
 
 
562 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  40.77 
 
 
482 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
885 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  40.42 
 
 
482 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  42.44 
 
 
567 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  44.4 
 
 
520 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  41.48 
 
 
502 aa  209  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  40.42 
 
 
482 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
483 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  43.33 
 
 
563 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
520 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  41.05 
 
 
482 aa  208  9e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  41.73 
 
 
507 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  41.85 
 
 
503 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  43.61 
 
 
417 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  41.85 
 
 
503 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  41.85 
 
 
503 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000698586  hitchhiker  0.0000000000000127286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  43.45 
 
 
569 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  42.75 
 
 
469 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.61 
 
 
553 aa  205  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  41.82 
 
 
498 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  43.21 
 
 
493 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  43.21 
 
 
493 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  43.21 
 
 
493 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  41.35 
 
 
469 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  43.18 
 
 
514 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  41.09 
 
 
575 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  43.18 
 
 
561 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  38.94 
 
 
487 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  43.49 
 
 
517 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  40.52 
 
 
544 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  41.35 
 
 
469 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  43.02 
 
 
497 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  43.02 
 
 
497 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.16 
 
 
520 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  40.37 
 
 
468 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0916  general secretory pathway protein E  41.36 
 
 
453 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.346946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  43.02 
 
 
497 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.98 
 
 
558 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  40.75 
 
 
491 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  43.02 
 
 
497 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  43.02 
 
 
497 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  39.73 
 
 
498 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  41.24 
 
 
574 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.16 
 
 
520 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  42.86 
 
 
493 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  42.86 
 
 
493 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.45 
 
 
521 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  42.54 
 
 
563 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  42.7 
 
 
549 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  39.44 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  39.44 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  39.44 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  39.44 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  39.44 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  39.44 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  39.44 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  40.6 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  40.82 
 
 
573 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 
463 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  42.12 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 
471 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3085  type II secretion system protein E  41.35 
 
 
560 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  39.3 
 
 
561 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  39.42 
 
 
477 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  41.26 
 
 
577 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  41.64 
 
 
461 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  41.89 
 
 
498 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
585 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  39.06 
 
 
498 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.01 
 
 
573 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  40.98 
 
 
515 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  43.07 
 
 
574 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  41.64 
 
 
461 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  42.38 
 
 
561 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  41.64 
 
 
461 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  39.79 
 
 
499 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  40.53 
 
 
520 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
571 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  40 
 
 
499 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  41.35 
 
 
498 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  41.85 
 
 
474 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  43.07 
 
 
577 aa  199  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  41.35 
 
 
499 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  41.35 
 
 
499 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  41.35 
 
 
499 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.11 
 
 
571 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  42.7 
 
 
574 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  41.51 
 
 
571 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  42.54 
 
 
561 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
570 aa  198  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  42.12 
 
 
566 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  40.98 
 
 
497 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  39.41 
 
 
582 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  40.98 
 
 
522 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>