More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2782 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 341 aa  698    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  94.13 
 
 		 341 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  87.39 
 
 		 341 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  87.34 
 
 		 350 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  92.72 
 
 		 156 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  92.72 
 
 		 156 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  80.92 
 
 		 153 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  80.92 
 
 		 153 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  37.16 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  36.34 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  36.84 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  36.84 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  38.93 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  37.16 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  36.34 
 
 		 368 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  67.11 
 
 		 185 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  82.08 
 
 		 106 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  34.8 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  33.52 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  34.6 
 
 		 355 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  33.91 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  33.63 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  34.02 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  32.84 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  34.25 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  33.86 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  34 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  31.51 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  32.65 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  33.09 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  31.74 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  36.41 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  37.43 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  27.92 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  31.82 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  36.94 
 
 		 214 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  40.27 
 
 		 189 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  34.29 
 
 		 173 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  32.67 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  32.51 
 
 		 235 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  33.12 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  34.97 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  40.87 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  30.73 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  30.73 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  35.54 
 
 		 185 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  37.5 
 
 		 130 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  36.18 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  36.21 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  28.85 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  28.85 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  40.66 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  28.85 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  28.85 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  28.85 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  33.64 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  33.67 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  27.98 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  22.88 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  22.88 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  22.88 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  22.88 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  22.88 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  22.88 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  24.89 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  22.66 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  22.66 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  22.66 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  25.15 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  25.15 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  25.15 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  22.68 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0907  hypothetical protein  25.14 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.129322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0495  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0657  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1083  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1129  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0066  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0091  ISSod1, transposase OrfB  22.66 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>