86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0952 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0952  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 164 aa  331  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.422759  hitchhiker  0.0019689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1100  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.327334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0067  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.821564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1803  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 570 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.42 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.47 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  27.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 425 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 425 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.32 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  31.36 
 
 		 1177 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  26.96 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 512 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  27.88 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 		 225 aa  47.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1065 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  30.39 
 
 		 923 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  33.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.11 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  35.71 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  27.59 
 
 		 868 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 503 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  32.04 
 
 		 1048 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  25.56 
 
 		 738 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  25.42 
 
 		 721 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 229 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  41.54 
 
 		 369 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 224 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 229 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  27.68 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2627  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  24.11 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  30 
 
 		 449 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  30.39 
 
 		 453 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.35 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 		 367 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  24.46 
 
 		 739 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  27.12 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  32.93 
 
 		 415 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.79 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.37 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 482 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 507 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 435 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 233 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 		 320 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  29.63 
 
 		 215 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 141 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 		 209 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 		 157 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 332 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 350 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 243 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  28.77 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 215 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.69 
 
 		 225 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 227 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4569  putative cyclic nucleotide binding protein  36.23 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 226 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.08 
 
 		 225 aa  41.2  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  31.93 
 
 		 1171 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  27.66 
 
 		 419 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 		 225 aa  40.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  24.39 
 
 		 528 aa  40.8  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>