More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0920 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  312  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.78 
 
 
329 aa  94  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.84 
 
 
831 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  42.19 
 
 
416 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.17 
 
 
684 aa  88.6  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.17 
 
 
489 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  40 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.84 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.78 
 
 
490 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.78 
 
 
490 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.59 
 
 
318 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  37.69 
 
 
344 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
448 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  40.83 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.08 
 
 
789 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.37 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.65 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.17 
 
 
267 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.66 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.43 
 
 
961 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.59 
 
 
264 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.83 
 
 
380 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  35.54 
 
 
850 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.04 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.64 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.77 
 
 
1402 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  42.62 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  38.79 
 
 
337 aa  74.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.89 
 
 
359 aa  74.7  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 
341 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.72 
 
 
278 aa  73.9  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  37.04 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  34.51 
 
 
1059 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.03 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.2 
 
 
271 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.29 
 
 
2413 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  35.34 
 
 
1003 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  29.01 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.8 
 
 
346 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
303 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.91 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  33.85 
 
 
260 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 
1430 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  34.23 
 
 
231 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.59 
 
 
376 aa  70.9  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.59 
 
 
376 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 
1877 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.45 
 
 
211 aa  70.5  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.96 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.09 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  33.8 
 
 
1160 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.62 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.6 
 
 
528 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.56 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.77 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.62 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1032 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.03 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  33.62 
 
 
381 aa  68.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.03 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.83 
 
 
380 aa  68.2  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.85 
 
 
685 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  30.47 
 
 
327 aa  67.8  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.54 
 
 
373 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  43.64 
 
 
358 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
1072 aa  67.4  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 
1012 aa  67.4  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.96 
 
 
235 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  40.95 
 
 
976 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 
557 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.9 
 
 
1196 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  33.61 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
1261 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.84 
 
 
225 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.74 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 
1226 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.36 
 
 
1493 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  33.81 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.45 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.7 
 
 
482 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.39 
 
 
997 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  39.32 
 
 
839 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  35 
 
 
1105 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.59 
 
 
1037 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.47 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  39.13 
 
 
365 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.6 
 
 
305 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  33.1 
 
 
978 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  39.47 
 
 
961 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  38.6 
 
 
679 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.13 
 
 
1263 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
464 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  35.78 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.4 
 
 
382 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.5 
 
 
552 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  33.86 
 
 
746 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>