More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0943 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 		 481 aa  944    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.59 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  34.35 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.76 
 
 		 441 aa  209  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.82 
 
 		 468 aa  206  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.21 
 
 		 480 aa  206  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.48 
 
 		 497 aa  200  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  31.61 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.78 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.75 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.79 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.39 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.74 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.45 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.05 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.7 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.89 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  31.52 
 
 		 440 aa  170  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  30.74 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.33 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  29.66 
 
 		 479 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.57 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.52 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.95 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.94 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  29.83 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.96 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.82 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.78 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.09 
 
 		 489 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.12 
 
 		 479 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.25 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.32 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.37 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.01 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.85 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1277  outer membrane protein TolC, putative  30.56 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.32 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.92 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.53 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  29.43 
 
 		 482 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.31 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.05 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.83 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.33 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.6 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.44 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.21 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.73 
 
 		 452 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  26.16 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.4 
 
 		 447 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  30.3 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.99 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  25.56 
 
 		 497 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.69 
 
 		 442 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.56 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  29.03 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  26.59 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  27.65 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.34 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  25.45 
 
 		 470 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  26.7 
 
 		 495 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  26.7 
 
 		 495 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  26.7 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  23.99 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.38 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  24.2 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.24 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.83 
 
 		 874 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  26.54 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  26.54 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.54 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  26.54 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  26.54 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  28.63 
 
 		 442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  26.54 
 
 		 493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.1 
 
 		 444 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.1 
 
 		 444 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  27.84 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.55 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  27.84 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.57 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.77 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.31 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.45 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  27.11 
 
 		 441 aa  134  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  26.33 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  27.66 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  27.13 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  26.48 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  28.94 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  25.99 
 
 		 489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  25.99 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  25.99 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  25.99 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  25.99 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.27 
 
 		 451 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  25.34 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>