68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0439 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0439  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  100 
 
 		 310 aa  639    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  39.61 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.2 
 
 		 392 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.14 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.78 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.81 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  26.95 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  23.47 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  22.89 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  29.27 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.61 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.83 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.2 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  23.39 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  25.31 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.69 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  21.55 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  21.35 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  23 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.48 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.58 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.89 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  27.8 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.97 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  24.1 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  22.7 
 
 		 545 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.39 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.65 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  21.03 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.89 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  22.08 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.87 
 
 		 550 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.32 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  22.83 
 
 		 553 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.33 
 
 		 731 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.59 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.05 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  25.83 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  22.19 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  21.22 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  27.27 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.25 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  20.33 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  21.05 
 
 		 727 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  23.19 
 
 		 731 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  28.36 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  18.9 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.93 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.9 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  21.29 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.71 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.62 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.95 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.26 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  24.8 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.08 
 
 		 559 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.55 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  18.52 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  32.82 
 
 		 525 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  20.44 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  32.76 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  20.3 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  21.59 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.21 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  22.83 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>