More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0133 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0133  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  384  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3186  ABC transporter related  50.79 
 
 
232 aa  177  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1013  ABC transporter related  41.94 
 
 
227 aa  155  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1787  ABC transporter related  46.24 
 
 
223 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169214  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1646  ABC transporter-related protein  46.24 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  38.96 
 
 
312 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  37.66 
 
 
312 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  35.8 
 
 
277 aa  97.8  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  29.95 
 
 
226 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  33.13 
 
 
221 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  36.08 
 
 
314 aa  95.5  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.37 
 
 
254 aa  95.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4038  ABC transporter-like  31.96 
 
 
384 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3776  ABC transporter-like protein protein  34.73 
 
 
225 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0766  ABC transporter related  37.66 
 
 
312 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.812823  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  36.26 
 
 
319 aa  91.3  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  33.72 
 
 
221 aa  90.9  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4467  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  29.32 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3820  ABC transporter related  32.18 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  38.67 
 
 
345 aa  90.5  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.71 
 
 
403 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.5 
 
 
398 aa  89.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01421  ABC transporter ATP-binding protein  33.14 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  32.97 
 
 
231 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.54 
 
 
277 aa  88.2  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.32 
 
 
277 aa  88.2  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.84 
 
 
277 aa  88.2  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1020  ABC transporter related  44.06 
 
 
352 aa  87.8  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  34.94 
 
 
579 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  32.91 
 
 
254 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
266 aa  87.8  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0493  ABC transporter, ATPase subunit  34.1 
 
 
262 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0860  ABC transporter related  35 
 
 
249 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  35.68 
 
 
530 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.52 
 
 
403 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  33.12 
 
 
254 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  36.26 
 
 
348 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 
248 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.86 
 
 
358 aa  86.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.14 
 
 
568 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.28 
 
 
250 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  33.56 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  32.53 
 
 
239 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.36 
 
 
395 aa  85.9  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1131  ABC transporter related  39.04 
 
 
570 aa  85.5  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.844878  normal  0.353633 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0811  ABC transporter related protein  35 
 
 
371 aa  85.1  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  34.16 
 
 
218 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.75 
 
 
343 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.75 
 
 
343 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  33.75 
 
 
343 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  32.02 
 
 
308 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  30.18 
 
 
226 aa  84.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  36.02 
 
 
553 aa  84.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.95 
 
 
284 aa  84.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.94 
 
 
531 aa  84.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  38.89 
 
 
370 aa  84.7  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  33.13 
 
 
593 aa  84.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  36.54 
 
 
543 aa  84.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  31.79 
 
 
296 aa  84.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  30.38 
 
 
226 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0169  cell division ATP-binding protein FtsE  33.13 
 
 
223 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  32.16 
 
 
295 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  32.79 
 
 
306 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2976  ABC transporter related  32.18 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.34 
 
 
344 aa  84  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1166  ABC transporter related  35.14 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00292656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  37.5 
 
 
527 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  34.36 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  31.06 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  31.94 
 
 
239 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.02 
 
 
641 aa  83.6  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  37.93 
 
 
386 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1128  ABC transporter related  34.46 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257867  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  30.2 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
551 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  32.14 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  31.1 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26461  ABC transporter ATP-binding protein  31.38 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  29.95 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0010  ABC transporter-related protein  38.97 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  39.74 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.78 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  33.74 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  37.09 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.33 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  34.07 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  29.9 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  32.95 
 
 
299 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1639  ATPase  29.28 
 
 
213 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.698343 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  34.34 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.67 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  36.76 
 
 
342 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1576  ABC transporter related  32.47 
 
 
381 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224014  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01391  ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 
227 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  28.81 
 
 
309 aa  82  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  33.15 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>