More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5661 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  99.43 
 
 		 348 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  100 
 
 		 348 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  99.14 
 
 		 348 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  94.25 
 
 		 363 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  94.54 
 
 		 348 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  64.86 
 
 		 363 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  62.35 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  62.35 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  64.74 
 
 		 370 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  56.98 
 
 		 378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  59.48 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  59.48 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  58.86 
 
 		 372 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  63.86 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  54.7 
 
 		 378 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  56.94 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  37.54 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  40.81 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.94 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  30.75 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.48 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  51.08 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  51.08 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  48.12 
 
 		 365 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 446 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  53.15 
 
 		 232 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 227 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  49.74 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  55 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.58 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  49.54 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.24 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  44.14 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  27.61 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 173 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.37 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  52 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  28.65 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.32 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.01 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  27.3 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.94 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.57 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.56 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  26.93 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.07 
 
 		 400 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.33 
 
 		 459 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.58 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.88 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 452 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  42.2 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  42.2 
 
 		 432 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.54 
 
 		 222 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39 
 
 		 265 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 162 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 323 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 389 aa  89.4  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41.88 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 476 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  41.28 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  40 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 160 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 323 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 345 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  38.83 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 224 aa  86.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 859 aa  85.9  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  41.74 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.72 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  41.74 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.61 
 
 		 173 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 177 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  43.41 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  40 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.22 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>