189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5460 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5081  Rieske (2Fe-2S) region  97.63 
 
 
338 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.040812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5169  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  97.63 
 
 
338 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.787894  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5460  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
338 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1843  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.27 
 
 
367 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1581  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.07 
 
 
335 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812557  normal  0.120024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.11 
 
 
335 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.5 
 
 
325 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3077  putative methylesterase  60 
 
 
334 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0868692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3571  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  58.15 
 
 
336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  50.33 
 
 
811 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  40 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.16 
 
 
364 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  32.74 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  25.97 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  37.18 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  39.44 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  36.62 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  26.79 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  37.18 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.16 
 
 
363 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.51 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.13 
 
 
388 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
374 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.62 
 
 
341 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.33 
 
 
324 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
370 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  35.9 
 
 
370 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  27.47 
 
 
355 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.42 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.59 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  25.39 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.39 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.39 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.6 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.93 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.27 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  32 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  31.17 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  44.62 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  25.6 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.6 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.03 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  40 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  35.21 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.62 
 
 
355 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  40 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.21 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  34.78 
 
 
334 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.21 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.93 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  37.68 
 
 
346 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  38.24 
 
 
386 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  37.14 
 
 
342 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  25.6 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  39.44 
 
 
363 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  32.94 
 
 
352 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  26.19 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.68 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.35 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.84 
 
 
362 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  32.58 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  28.4 
 
 
343 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  25.75 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.21 
 
 
354 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.33 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  41.25 
 
 
342 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  36.99 
 
 
668 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.4 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.58 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.42 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.41 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.65 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.21 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
386 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.39 
 
 
444 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.39 
 
 
444 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.25 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.85 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.49 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.29 
 
 
358 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  36.11 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.25 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.67 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.23 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  29.07 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.99 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.44 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>