52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3203 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  761    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  38.02 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  38.56 
 
 		 348 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  37.93 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  31.39 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  26.64 
 
 		 519 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  22.92 
 
 		 490 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  28.57 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  25.82 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  29.46 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  26.09 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  29.1 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  24.34 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  26.84 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.71 
 
 		 900 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  28.66 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 		 1231 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  22.67 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  26.51 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  26.51 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  26.51 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  26.23 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  27.49 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  23.83 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  23.27 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  24.51 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  25 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  28.4 
 
 		 314 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  32.98 
 
 		 613 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  22.22 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  35.11 
 
 		 605 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 591 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  24.54 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  24.08 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.26 
 
 		 506 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.82 
 
 		 532 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  23.59 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  27.83 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  26.14 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  24.62 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.61 
 
 		 584 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 		 590 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  26.05 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  25.32 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  28.7 
 
 		 652 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.08 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.36 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  26.02 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.85 
 
 		 558 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  31.58 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>