More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2233 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  79.02 
 
 		 205 aa  340  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  79.71 
 
 		 207 aa  339  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  79.02 
 
 		 205 aa  338  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  72.91 
 
 		 205 aa  317  7e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  62.19 
 
 		 208 aa  271  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  61.11 
 
 		 203 aa  270  9e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  62.19 
 
 		 211 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  63.4 
 
 		 210 aa  261  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  61.86 
 
 		 210 aa  257  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  56.92 
 
 		 217 aa  251  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  61.11 
 
 		 218 aa  251  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  57.58 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  57.58 
 
 		 229 aa  247  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  56.57 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  59.6 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  58.08 
 
 		 202 aa  244  9e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  57.58 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  56.57 
 
 		 202 aa  241  7e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  56.12 
 
 		 197 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  55.84 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  56.57 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  54.5 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  57.73 
 
 		 215 aa  228  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  57.37 
 
 		 202 aa  227  7e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  49.74 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  50 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  45.5 
 
 		 238 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  44.67 
 
 		 256 aa  175  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  46.91 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  46.6 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  46.24 
 
 		 252 aa  160  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  44.74 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  42.57 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  40.94 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  39.38 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  39.38 
 
 		 166 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  41.78 
 
 		 166 aa  104  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  41.78 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  42.96 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  37.42 
 
 		 169 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  35.8 
 
 		 172 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  39.38 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  37.29 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  38.69 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  37.89 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  42.25 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  36.99 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  42.25 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  34.93 
 
 		 172 aa  95.5  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  38.82 
 
 		 166 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  37.91 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  38.22 
 
 		 173 aa  94.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  38.56 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  38.56 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  40.41 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  37.27 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  38.36 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  37.67 
 
 		 162 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  38.82 
 
 		 191 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  39.46 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  38.82 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  36.88 
 
 		 147 aa  92.8  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  40.52 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  36.88 
 
 		 147 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  40.52 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  38.16 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  39.04 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  37.33 
 
 		 173 aa  92.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  38.78 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  37.5 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  37.5 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  36.6 
 
 		 166 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  40.26 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  37.91 
 
 		 166 aa  91.3  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  38.78 
 
 		 161 aa  91.3  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  37.01 
 
 		 186 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  39.87 
 
 		 169 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  37.41 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  36.99 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  35.29 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  36.73 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  36.18 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  39.04 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  36.84 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>