239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3731 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  90 
 
 		 177 aa  299  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2382  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  254  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2429  LemA family protein  78.09 
 
 		 178 aa  254  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2423  LemA family protein  78.09 
 
 		 178 aa  254  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0706074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  53.5 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  44.23 
 
 		 180 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  45.7 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  38.82 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  42.29 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  42.69 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  42.11 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  40.59 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  41.07 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  40.12 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  39.43 
 
 		 184 aa  120  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  39.18 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  39.08 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  39.41 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  39.51 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  40.38 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  38.56 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  41.07 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  40.24 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  38.29 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  44.44 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  39.1 
 
 		 188 aa  114  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  39.1 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  43.66 
 
 		 249 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  42.04 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  39.88 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  40.13 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  39.47 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  39.47 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  41.1 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  32.16 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  38.41 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  35.26 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  36.77 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  36.25 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  39.16 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  40.65 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  38.04 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  34.29 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  33.33 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  40.82 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  39.18 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  33.33 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  39.38 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  35.9 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  37.3 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  35.81 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  33.71 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  33.89 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  40.26 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  36.32 
 
 		 201 aa  98.6  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  37.82 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  37.82 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  37.82 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  41.22 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  35.15 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  36.21 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  38.75 
 
 		 200 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  34.19 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  36.36 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  35.06 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  34.71 
 
 		 207 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  34.71 
 
 		 207 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  35.09 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  37.68 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  32.9 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  33.33 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  35.88 
 
 		 214 aa  94.7  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  35.84 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  33.33 
 
 		 212 aa  94.4  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  31.07 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  31.07 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  31.07 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  37.21 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  38.51 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  38.82 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  36.88 
 
 		 220 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  37.84 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  32.32 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  36.16 
 
 		 204 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  34.32 
 
 		 195 aa  91.7  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  35.4 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  33.13 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  32.53 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  35.22 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  35.59 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  36.16 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  35.62 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  31.68 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  31.87 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  37.58 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  37.91 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  37.06 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>