More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3668 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2238  ABC transporter related protein  67.9 
 
 
532 aa  679    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000471653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5972  ABC transporter, ATP-binding protein  66.97 
 
 
532 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.490457  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  64.02 
 
 
532 aa  648    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.87 
 
 
532 aa  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  64.09 
 
 
532 aa  661    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  69.43 
 
 
552 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  100 
 
 
542 aa  1074    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  83.06 
 
 
542 aa  895    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  66.05 
 
 
532 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  66.24 
 
 
532 aa  674    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2326  ABC transporter related  66.24 
 
 
532 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386504  normal  0.590728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  64.76 
 
 
532 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  69.74 
 
 
537 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2802  ABC transporter related protein  65.13 
 
 
532 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15491  normal  0.0601311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  90.96 
 
 
542 aa  980    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  66.11 
 
 
532 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.346167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  66.05 
 
 
532 aa  695    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  77.76 
 
 
542 aa  781    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  90.96 
 
 
542 aa  980    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  68.08 
 
 
537 aa  740    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  70.3 
 
 
533 aa  738    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  69.93 
 
 
537 aa  692    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3301  ABC transporter related  68.51 
 
 
534 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2465  ABC transporter related protein  67.95 
 
 
541 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0270517  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5134  ABC transporter related  76.65 
 
 
542 aa  814    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  65.31 
 
 
532 aa  691    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2396  ABC transporter related protein  84.32 
 
 
542 aa  894    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.647694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2289  ABC transporter related  74.59 
 
 
541 aa  764    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000329331  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  64.76 
 
 
532 aa  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  90.96 
 
 
542 aa  980    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  95.2 
 
 
563 aa  1016    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  86.72 
 
 
542 aa  916    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.87 
 
 
532 aa  686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  61.69 
 
 
534 aa  648    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.1 
 
 
532 aa  621  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  56.88 
 
 
533 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  56.28 
 
 
539 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  56.32 
 
 
533 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  33.94 
 
 
685 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
663 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
663 aa  296  5e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  32.95 
 
 
643 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  33.65 
 
 
544 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  36.13 
 
 
545 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  36.26 
 
 
645 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.68 
 
 
637 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.23 
 
 
638 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.65 
 
 
630 aa  290  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  35.61 
 
 
540 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  35.61 
 
 
540 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 
540 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  35.42 
 
 
540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.78 
 
 
646 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.21 
 
 
540 aa  283  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  34.86 
 
 
540 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
645 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  33.21 
 
 
653 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.64 
 
 
567 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  35.15 
 
 
545 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35 
 
 
540 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  34.74 
 
 
649 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.52 
 
 
767 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
688 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.84 
 
 
668 aa  277  3e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  34.57 
 
 
540 aa  277  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  33.04 
 
 
651 aa  277  4e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  35.91 
 
 
659 aa  276  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.77 
 
 
540 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.71 
 
 
540 aa  276  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.53 
 
 
564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.08 
 
 
549 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  32.7 
 
 
639 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.91 
 
 
543 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.48 
 
 
649 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.3 
 
 
544 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 
559 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.2 
 
 
548 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.01 
 
 
548 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.2 
 
 
548 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.28 
 
 
542 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
656 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.77 
 
 
541 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  31.98 
 
 
535 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.27 
 
 
575 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.1 
 
 
643 aa  271  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  37.05 
 
 
574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
632 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  34.9 
 
 
648 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
648 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.77 
 
 
540 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.77 
 
 
620 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  35.24 
 
 
540 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  32.37 
 
 
650 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  34.1 
 
 
540 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  33.21 
 
 
565 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  35.88 
 
 
545 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0433  ABC transporter related  35.95 
 
 
532 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.893812  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  32.05 
 
 
634 aa  269  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  32.97 
 
 
650 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.86 
 
 
644 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>