58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1945 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  72.19 
 
 		 159 aa  228  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  51.01 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  51.01 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  51.01 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  50.68 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 		 172 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  52.34 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  52.58 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  40.49 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  52.53 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  38.65 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  51 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  38.65 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  38.65 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  38.65 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  38.65 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  38.04 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  44.33 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  46.94 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  36.59 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  49 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  34.78 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  41.41 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  43.43 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  42.42 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  40.4 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  36 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  43 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  36.08 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  41.41 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  33.99 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  42.86 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  37 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  31.48 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  29.81 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  35.51 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  34.69 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  30.92 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  28.75 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  24.52 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08470  nucleoside diphosphate kinase regulator  27.54 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2743  GreA/GreB family elongation factor  40.32 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00755708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  34.74 
 
 		 157 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  28.42 
 
 		 155 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  31.08 
 
 		 165 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0339  GreA/GreB family elongation factor  29.58 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0851  transcription elongation factor GreA/GreB region  30.26 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0934  GreA/GreB family elongation factor  35.62 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>