96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0896 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
545 aa  1115    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
545 aa  1115    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 
581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  29.24 
 
 
596 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  28.85 
 
 
576 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 
589 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 
589 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 
574 aa  204  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  26.83 
 
 
565 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 
596 aa  187  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  25.61 
 
 
596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 
604 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  26.74 
 
 
595 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  26.71 
 
 
598 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  24.96 
 
 
599 aa  154  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  23.65 
 
 
593 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  22.84 
 
 
589 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  22.43 
 
 
592 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  21.83 
 
 
610 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  20.49 
 
 
602 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  22.18 
 
 
641 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  30.17 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  19.37 
 
 
606 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  20 
 
 
578 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  21.56 
 
 
589 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  25.82 
 
 
218 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  23.57 
 
 
599 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  26.24 
 
 
587 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 
239 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.42 
 
 
668 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  24.28 
 
 
788 aa  57  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  24.28 
 
 
907 aa  57  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  24.28 
 
 
774 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 
602 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  20.71 
 
 
499 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 
748 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 
756 aa  55.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  22.09 
 
 
611 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  22.08 
 
 
755 aa  54.7  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  28.41 
 
 
212 aa  53.9  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 
248 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  22.34 
 
 
617 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  25.52 
 
 
794 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  24.32 
 
 
792 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  24.26 
 
 
778 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  23.5 
 
 
572 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  25.17 
 
 
1003 aa  51.6  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  20.63 
 
 
618 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  23.41 
 
 
785 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  20.37 
 
 
576 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  22.45 
 
 
1017 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  23.4 
 
 
777 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  26.79 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  23.26 
 
 
687 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1781  hypothetical protein  27.16 
 
 
222 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  20.88 
 
 
645 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 
599 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  20.9 
 
 
725 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  23.44 
 
 
668 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  19.88 
 
 
676 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  21.75 
 
 
668 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  33.85 
 
 
1048 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  21.87 
 
 
780 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  22.06 
 
 
841 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  27.97 
 
 
872 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  21.54 
 
 
735 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  21.66 
 
 
838 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  33.85 
 
 
858 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  26.83 
 
 
366 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  33.85 
 
 
930 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  33.85 
 
 
896 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  35.29 
 
 
895 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  33.85 
 
 
1057 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  20.33 
 
 
714 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  21.66 
 
 
841 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  21.83 
 
 
753 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  21.2 
 
 
730 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  21.94 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  21.66 
 
 
841 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  21.02 
 
 
709 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  22.32 
 
 
656 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  24.63 
 
 
712 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  26.83 
 
 
366 aa  44.3  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  26.83 
 
 
366 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 
275 aa  44.3  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  30.65 
 
 
792 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  21.5 
 
 
775 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  21.5 
 
 
775 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  21.5 
 
 
775 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  21.5 
 
 
775 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  26.27 
 
 
731 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  21.5 
 
 
775 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  21.5 
 
 
775 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  27.59 
 
 
655 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  22.69 
 
 
226 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>