More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3976 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  97.44 
 
 		 390 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  100 
 
 		 390 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  88.97 
 
 		 390 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  68.8 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  70.1 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  67.77 
 
 		 391 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  50.26 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  46.91 
 
 		 393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  49.09 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  50 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  47.34 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  45.48 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 392 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  44.9 
 
 		 386 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  45.93 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  49.34 
 
 		 390 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  48.58 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  48.1 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  44.62 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  45.19 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  43.48 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.23 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.97 
 
 		 400 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.48 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  41.91 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  46.84 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 414 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  44.5 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.55 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  43.64 
 
 		 385 aa  258  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  41.84 
 
 		 382 aa  258  9e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  41.42 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.48 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.53 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.44 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  45 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.38 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.65 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.49 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 392 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.7 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  43.9 
 
 		 1135 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.56 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.33 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.45 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  38.3 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.37 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  38.48 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.76 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  42.67 
 
 		 408 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  43.8 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  45.5 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.68 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  37.33 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  45.11 
 
 		 1143 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  42.59 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  43.46 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  35.37 
 
 		 492 aa  239  9e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  39.74 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.1 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  36.64 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  40.48 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  42.68 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.93 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.24 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  40.97 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.22 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  44.94 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  42.13 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  38.82 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  40.65 
 
 		 422 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.97 
 
 		 1139 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  41.86 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  42.19 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.02 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.58 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 400 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.41 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.38 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  46.99 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  39.78 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  39.89 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  36.71 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.72 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 393 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  40.86 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  44.41 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  38.28 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  39.95 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>