More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0617 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  100 
 
 		 388 aa  749    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  51.32 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  47.27 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  48.71 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  46.75 
 
 		 390 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  46.08 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  45.76 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  45.52 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 533 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  44.19 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  44.19 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  46.49 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  46.55 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  45.05 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  45.69 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  45.32 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  46.79 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  33.78 
 
 		 492 aa  241  1e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  44.39 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  47.91 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 387 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  43.4 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  36.7 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1766  aminotransferase, class V  55 
 
 		 380 aa  229  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101589  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.47 
 
 		 393 aa  228  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  42.16 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  45.5 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  42.16 
 
 		 1143 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.28 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  42.64 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  44.78 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.91 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  45.57 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  38.61 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  35.12 
 
 		 530 aa  206  6e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  39.95 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  43.98 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  37.05 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  39.74 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  35.79 
 
 		 392 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  33.67 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  35.71 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  34.09 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  41.49 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  41.5 
 
 		 1139 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.46 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  39.52 
 
 		 409 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  32.64 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  38.87 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  40.53 
 
 		 373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  37.24 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  44.89 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  38.97 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  36.81 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3724  Cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252129  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.68 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  43.81 
 
 		 407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  40 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  44.85 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  41.03 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  38.89 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.39 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  31.96 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  38.24 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  35.16 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  34 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  35.38 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  34.68 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  36.79 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  37.15 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.76 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  39.59 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  36.36 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  32.64 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  40.27 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  32.64 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  34.66 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  38.25 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  35.04 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  32.84 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  43.52 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  40.98 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.16 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.38 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  41.14 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  35.37 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  38.22 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  41.22 
 
 		 412 aa  190  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  40.16 
 
 		 391 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  34.38 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  35.25 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  34.09 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  40.42 
 
 		 355 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>