More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1715 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 462 aa  934    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  97.62 
 
 		 462 aa  885    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  96.02 
 
 		 456 aa  816    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  62.36 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  48.39 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  48.63 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  50.59 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  48.63 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  46.39 
 
 		 451 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  47.14 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  47.14 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  46.05 
 
 		 468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  44.66 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  40.81 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  44.5 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  40.52 
 
 		 449 aa  302  9e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  42.08 
 
 		 454 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  37.04 
 
 		 474 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.98 
 
 		 459 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.05 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  37.78 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  38.14 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.95 
 
 		 459 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.28 
 
 		 450 aa  226  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.95 
 
 		 443 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.05 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.91 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  37.82 
 
 		 449 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.64 
 
 		 451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.54 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.86 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.38 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  25.91 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  35.67 
 
 		 1024 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.1 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1024 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  31.25 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.8 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 989 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  29.67 
 
 		 1000 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.65 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46355  predicted protein  25.9 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111321  normal  0.450226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.91 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.84 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.59 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1015 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  27.61 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  32.67 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  32.67 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.82 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.37 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  26.39 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  32.67 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  30.67 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.5 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  24.02 
 
 		 1015 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  31.96 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  34.18 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.9 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.81 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.57 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  34.92 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  31.05 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  29.13 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.73 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  26.98 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  33.9 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.96 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.9 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  32.34 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  38.71 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  29.78 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  29.6 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.05 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.1 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  32.81 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  32.47 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.29 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.86 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  25.98 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  30.29 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.15 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  30.29 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  30.15 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  35.59 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  30.29 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  28.25 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.15 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>