More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0331 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  98.84 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  93.05 
 
 		 259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  76.31 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  74.9 
 
 		 260 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  64.05 
 
 		 261 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  61.32 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  61.98 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  60.08 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  59.02 
 
 		 249 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  61.26 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.88 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.67 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.78 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.31 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.78 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.97 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.15 
 
 		 286 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.37 
 
 		 268 aa  215  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.78 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.64 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.56 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.89 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.94 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  49.76 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.34 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  47.11 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  43.36 
 
 		 280 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.86 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  45.38 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  44.96 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.47 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  50.88 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  48.88 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.12 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.94 
 
 		 283 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.4 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.83 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.88 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.77 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.27 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  41 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.54 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  44.53 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.81 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.89 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  43.02 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50.65 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.76 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 279 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.02 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.02 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  49.33 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  49.33 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  43.93 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  50.66 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 437 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.26 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  47.58 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.14 
 
 		 274 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  52.78 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  44.94 
 
 		 445 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  45.57 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.33 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  48.39 
 
 		 265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.54 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  49.54 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  44.66 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.9 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.35 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  47.32 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.54 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  53.4 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.94 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  47.32 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.44 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  45.34 
 
 		 445 aa  198  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>