121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4536 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 374 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  38.71 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  31.19 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.79 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.79 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.79 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  28.79 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  28.79 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.79 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.13 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.59 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  27.73 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 362 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  28.19 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.06 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 368 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 369 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 368 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  25.71 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  26.16 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  24.17 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  23.66 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.68 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  24.52 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.27 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  25 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  23.28 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  22.52 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  21.76 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  21.58 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  24.36 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  24.04 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1275  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  0.567692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  19.14 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1686  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.55 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  22.57 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  23.1 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  23.53 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3878  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.15 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  25.09 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  25.09 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4488  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1606  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.55 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 326 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.843064  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.51 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  39.62 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  39.62 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  39.62 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  39.62 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  41.51 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.62 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>