More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4478 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4478  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  40.68 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3249  ABC transporter related  43.29 
 
 		 749 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  40.76 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  43.52 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  42.61 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.38 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  40.69 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  40.53 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  41.42 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  38.4 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  41.84 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  39.35 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  41.7 
 
 		 247 aa  168  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 247 aa  168  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  39.32 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  38.96 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3153  ABC transporter related  41.99 
 
 		 803 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  40.72 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  40.61 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.21 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  39.83 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  40.85 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3191  ABC transporter related  41.56 
 
 		 748 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  40.83 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  38.96 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  40.69 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  39.39 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  40.87 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  40.27 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  39.39 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  38.72 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1134  ABC transporter related  42.13 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.767247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  37.5 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  39.74 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  40.26 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  39.83 
 
 		 270 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  37.55 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.56 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  42.27 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  37.02 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  37.66 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0215  ABC transporter related  40 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  40.69 
 
 		 235 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  36.75 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  40.43 
 
 		 241 aa  161  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3206  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  37.66 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  39.83 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  37.89 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.5 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  38.72 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  38.53 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  40.43 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  37.23 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  37.17 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  38.36 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  38.4 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  41.99 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.43 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  39.83 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  40.47 
 
 		 694 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  39.83 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.34 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.26 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  38.63 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1852  ABC transporter related  40.62 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231349  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  38.71 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  35.91 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  36.57 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  38.01 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  39.06 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  40.93 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  38.53 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  37.1 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  37.87 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  39.73 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  37.23 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  39.06 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  35.71 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>