More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4092 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 411 aa  836    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  61.78 
 
 		 427 aa  532  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  61.74 
 
 		 419 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  64.18 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  58.27 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  57.38 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  57.43 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  53.61 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  42.01 
 
 		 414 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  42.4 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  41.33 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  44.12 
 
 		 415 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  43.73 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  39.71 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  40.58 
 
 		 409 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  39.43 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  39.71 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  39.66 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  39.85 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.61 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  41.89 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.32 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  41.87 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 455 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.26 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  35.99 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  36.21 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.99 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  39.69 
 
 		 418 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.21 
 
 		 445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  41.35 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  41.65 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  36.79 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  38.21 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 454 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  37.14 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.44 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  37.03 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  39.42 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  39.15 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  37.38 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  38.62 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  36.79 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  37.84 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  36.89 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  36.25 
 
 		 448 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  35.64 
 
 		 470 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  39.79 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  34.66 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  35.79 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  35.11 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  37.4 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  34.31 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.1 
 
 		 418 aa  219  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 		 435 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  38.17 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  36.89 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 		 436 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  36.29 
 
 		 438 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  38.93 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  38.4 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  38.15 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  35.19 
 
 		 481 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  39.3 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  38.15 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  41.21 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  37.2 
 
 		 440 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  36.34 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  35.19 
 
 		 469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.58 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  39 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  36.38 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  37.94 
 
 		 490 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  36.38 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  35.31 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  36.87 
 
 		 491 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  37.6 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.11 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  34.39 
 
 		 464 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  35.77 
 
 		 514 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.77 
 
 		 430 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  35.59 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  36.57 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  39.23 
 
 		 407 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  34.84 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.26 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  37.56 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  36.18 
 
 		 457 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  36.64 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  35.99 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>