57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3298 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  289  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  38.93 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  35.03 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  36.49 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  35.37 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  36.49 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  36.73 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  38.24 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  29.94 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  30.57 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  37.41 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  32.74 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  35.25 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  34.39 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  39.46 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  32.88 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  35.9 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  34.39 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  35.81 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  33.81 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  39.71 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  39.71 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  30.07 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  33.33 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  33.76 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  30.77 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  33.55 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  37.17 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  36.75 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  37.16 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  41.46 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  28.66 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  27.4 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  31.88 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  31.88 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  32.77 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  48.72 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.08 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  31.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  26.32 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  30.26 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  30.26 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  47.62 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26.14 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6019  hypothetical protein  28.23 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  34.91 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  32.48 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  26.43 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>