More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1987 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  69.44 
 
 
295 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  70.1 
 
 
291 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  49.15 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  46.92 
 
 
296 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  49.12 
 
 
299 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  46.58 
 
 
295 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  46.42 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  46.5 
 
 
303 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  51.19 
 
 
293 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  46.48 
 
 
296 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  44.18 
 
 
298 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  44.18 
 
 
295 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  46.67 
 
 
295 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  45.73 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  45.73 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  47.18 
 
 
296 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  45.05 
 
 
295 aa  248  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  48.06 
 
 
295 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  47.1 
 
 
295 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  43.69 
 
 
295 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  46.08 
 
 
295 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  44.29 
 
 
305 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  43.82 
 
 
294 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  49.01 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  46.48 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  43.6 
 
 
305 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  42.71 
 
 
307 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  45.73 
 
 
295 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  40.83 
 
 
296 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  38.66 
 
 
331 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  38.94 
 
 
326 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  39.27 
 
 
326 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  39.27 
 
 
326 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  40.26 
 
 
320 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  38.61 
 
 
326 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  40.26 
 
 
320 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  40.07 
 
 
320 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  39.17 
 
 
320 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  43.66 
 
 
310 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  39.13 
 
 
313 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  41.1 
 
 
324 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  39.47 
 
 
227 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 
264 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  39.08 
 
 
322 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  39.08 
 
 
303 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  39.08 
 
 
303 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  40.09 
 
 
305 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  36.86 
 
 
290 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  36.47 
 
 
290 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  35.74 
 
 
268 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  48.87 
 
 
136 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
271 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  38.1 
 
 
318 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  32.55 
 
 
275 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  38.07 
 
 
292 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  34.9 
 
 
271 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  32.66 
 
 
275 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  34.9 
 
 
271 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  34.51 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 
271 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  34.51 
 
 
271 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  34.51 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  30.29 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  34.21 
 
 
270 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  34.44 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  34.12 
 
 
269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  31.85 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  33.22 
 
 
292 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  32.35 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  34.12 
 
 
270 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 
290 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  30.62 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  31.38 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  31.38 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  31.38 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  31.38 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  37.23 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.94 
 
 
254 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 
300 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  35.37 
 
 
227 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
227 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  36.75 
 
 
232 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  32.48 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>