More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0498 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0498  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 297 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 297 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0606  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3989  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119211  normal  0.0654574 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3862  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0804  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0738  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2313  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3703  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1471  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1510  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0433683  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0252  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 216 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.682198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  31.16 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0956  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  26.53 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  30.49 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0946  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  31.2 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  26.53 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  31.2 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  31.2 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  26.53 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  26.53 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  26.53 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  26.53 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  26.53 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 314 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0335  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0307  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.42 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4431  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  28.36 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  32.75 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  30.04 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.04 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.04 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.04 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  30.04 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.04 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.37 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  29.28 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  30.83 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>