More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2403 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
264 aa  517  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.85 
 
 
261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2004  Ornithine carbamoyltransferase  62.55 
 
 
269 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.61 
 
 
266 aa  238  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.61 
 
 
266 aa  238  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.22 
 
 
266 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  46.22 
 
 
266 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  46.22 
 
 
266 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  46.22 
 
 
266 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.22 
 
 
266 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  46.22 
 
 
266 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
266 aa  232  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.61 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 
261 aa  218  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  44.06 
 
 
286 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  44.09 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.31 
 
 
256 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.32 
 
 
267 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  41.6 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.22 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  42.57 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.37 
 
 
257 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  42.74 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.37 
 
 
276 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  40.96 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.96 
 
 
256 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 
288 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  38.64 
 
 
269 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
267 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
273 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.53 
 
 
257 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  43.53 
 
 
273 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  45.53 
 
 
256 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  45.12 
 
 
256 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  42.8 
 
 
287 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  41.04 
 
 
284 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
281 aa  188  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.69 
 
 
262 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 
258 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
272 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  43.32 
 
 
271 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  44.62 
 
 
259 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
265 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  44.62 
 
 
259 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
287 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  42.04 
 
 
260 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  43.31 
 
 
273 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  41.96 
 
 
272 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 
272 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.7 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
271 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.85 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  41.11 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  41.11 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  41.11 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  41.11 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  39.04 
 
 
256 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.57 
 
 
278 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
271 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
271 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42 
 
 
264 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01122  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  44.4 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  38.98 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  40.24 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
272 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.58 
 
 
266 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.43 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  46.31 
 
 
274 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
272 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00609739  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
269 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682654  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4708  Ornithine carbamoyltransferase  45.2 
 
 
258 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0199227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
260 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
268 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  41.8 
 
 
270 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  42.91 
 
 
273 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
271 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
272 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.61 
 
 
273 aa  175  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1637  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.1 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>