More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1349 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 682 aa  1370    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  42.1 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  37.16 
 
 		 582 aa  297  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  33.05 
 
 		 587 aa  293  7e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  31.62 
 
 		 585 aa  273  8.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  29.69 
 
 		 949 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  32.16 
 
 		 904 aa  196  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  32.15 
 
 		 903 aa  194  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  29.61 
 
 		 939 aa  193  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  28.64 
 
 		 896 aa  193  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  30.86 
 
 		 924 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  29.95 
 
 		 896 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  32.24 
 
 		 933 aa  190  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  29.85 
 
 		 893 aa  188  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  30.43 
 
 		 896 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  28.82 
 
 		 946 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  29.44 
 
 		 936 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  29.92 
 
 		 956 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  31.62 
 
 		 903 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  32.07 
 
 		 936 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  34.06 
 
 		 912 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  31.46 
 
 		 950 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  29.37 
 
 		 943 aa  183  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  30.55 
 
 		 945 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 905 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  29.36 
 
 		 893 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  31 
 
 		 892 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  29.62 
 
 		 922 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  26.58 
 
 		 879 aa  178  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  29.83 
 
 		 922 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  30.49 
 
 		 926 aa  177  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 879 aa  177  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  29.45 
 
 		 885 aa  177  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  26.87 
 
 		 879 aa  177  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  29.85 
 
 		 910 aa  176  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  29.55 
 
 		 988 aa  176  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  31.01 
 
 		 945 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  29.65 
 
 		 936 aa  176  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  32.33 
 
 		 939 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  29.06 
 
 		 946 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  30.24 
 
 		 932 aa  173  7.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  32.03 
 
 		 850 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  30.77 
 
 		 906 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  26.09 
 
 		 908 aa  172  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  29.17 
 
 		 908 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 941 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  28.1 
 
 		 939 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  30.43 
 
 		 892 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  30.08 
 
 		 930 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  30.04 
 
 		 935 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  28.24 
 
 		 902 aa  171  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  29.09 
 
 		 945 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  29.6 
 
 		 1024 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  29.98 
 
 		 928 aa  171  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  27.36 
 
 		 934 aa  171  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 928 aa  171  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 928 aa  171  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  30.31 
 
 		 928 aa  171  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 928 aa  171  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  30.23 
 
 		 855 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 928 aa  171  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 928 aa  171  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 890 aa  171  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  28.33 
 
 		 934 aa  171  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  30.44 
 
 		 944 aa  171  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  30.64 
 
 		 928 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  29.84 
 
 		 915 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 928 aa  170  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  29.18 
 
 		 924 aa  170  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 936 aa  170  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  26.99 
 
 		 898 aa  170  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  34.35 
 
 		 956 aa  170  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 932 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  30.33 
 
 		 923 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  30.08 
 
 		 935 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 932 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  27.23 
 
 		 1022 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  27.08 
 
 		 926 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 932 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  27.42 
 
 		 951 aa  169  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 891 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  29.11 
 
 		 922 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  29.95 
 
 		 892 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 911 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  30.17 
 
 		 923 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  30.17 
 
 		 923 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  31.8 
 
 		 937 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  28.44 
 
 		 935 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  30.72 
 
 		 928 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  30.17 
 
 		 926 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  30.17 
 
 		 926 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  28.48 
 
 		 921 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  30.17 
 
 		 926 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  30.16 
 
 		 928 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  30.17 
 
 		 926 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  30.21 
 
 		 915 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  28.48 
 
 		 921 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  28.93 
 
 		 918 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  30.72 
 
 		 928 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  30.36 
 
 		 928 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>