More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0886 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
518 aa  939    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.53 
 
 
509 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
528 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
550 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
564 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.27 
 
 
572 aa  186  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
606 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.76 
 
 
547 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.5 
 
 
551 aa  161  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  35.43 
 
 
576 aa  160  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
547 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
663 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
634 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
540 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
565 aa  149  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
597 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
544 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
532 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
601 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
543 aa  113  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.05 
 
 
515 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 
569 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
561 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  25.76 
 
 
516 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
563 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.66 
 
 
551 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
564 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
586 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
576 aa  96.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 
740 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
575 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.66 
 
 
569 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  39.39 
 
 
592 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
743 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.14 
 
 
692 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.66 
 
 
692 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.77 
 
 
742 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.6 
 
 
572 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 
560 aa  88.2  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  30.66 
 
 
555 aa  87  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.75 
 
 
516 aa  87  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  29.87 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.58 
 
 
543 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  24.9 
 
 
514 aa  84.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
565 aa  83.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.8 
 
 
574 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.67 
 
 
741 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.93 
 
 
580 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 
741 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 
741 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.12 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  24.31 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25.76 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  36.27 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.51 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.26 
 
 
544 aa  79.7  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.76 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
728 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
528 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.21 
 
 
579 aa  78.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.97 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 
700 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.22 
 
 
261 aa  76.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0236237  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.39 
 
 
692 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.61 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.36 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.81 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  29.42 
 
 
545 aa  74.3  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  28.39 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  26.35 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
559 aa  74.3  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.62 
 
 
758 aa  73.6  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 
592 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  24.95 
 
 
543 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  25.27 
 
 
540 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  37.04 
 
 
227 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.72 
 
 
275 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.43 
 
 
278 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.48 
 
 
574 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  31.68 
 
 
229 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  31 
 
 
265 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1688  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  34.62 
 
 
286 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0527637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.28 
 
 
275 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.25 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  26.13 
 
 
535 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
269 aa  72.8  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.84 
 
 
278 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  25.37 
 
 
536 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.61 
 
 
692 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>