More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0841 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
361 aa  714    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  69.44 
 
 
361 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.690404  normal  0.0268262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1946  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  69.23 
 
 
360 aa  478  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152977  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  62.95 
 
 
361 aa  457  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.32 
 
 
359 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.21 
 
 
382 aa  287  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.42 
 
 
382 aa  278  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.89 
 
 
382 aa  272  7e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.29 
 
 
379 aa  266  4e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44 
 
 
387 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.13 
 
 
362 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.09 
 
 
360 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.8 
 
 
384 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.9 
 
 
362 aa  260  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.44 
 
 
379 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.82 
 
 
379 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.43 
 
 
362 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.26 
 
 
378 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.51 
 
 
377 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.01 
 
 
384 aa  255  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.74 
 
 
382 aa  255  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.53 
 
 
381 aa  255  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.47 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.1 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.68 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.85 
 
 
385 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  44.79 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  42.36 
 
 
362 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.13 
 
 
389 aa  249  6e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.02 
 
 
382 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.41 
 
 
375 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  42.52 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.11 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.94 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.23 
 
 
388 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.58 
 
 
386 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.96 
 
 
388 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.67 
 
 
388 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.02 
 
 
383 aa  239  5e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
410 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.93 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.73 
 
 
396 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  40.16 
 
 
388 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.16 
 
 
388 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.27 
 
 
388 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.93 
 
 
388 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.74 
 
 
389 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  40.32 
 
 
392 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.71 
 
 
409 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1157  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.75 
 
 
388 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.38 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.99 
 
 
393 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.96 
 
 
382 aa  235  9e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.25 
 
 
391 aa  235  9e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.87 
 
 
387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.64 
 
 
388 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.43 
 
 
400 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.62 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.21 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.11 
 
 
387 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.52 
 
 
392 aa  233  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.11 
 
 
387 aa  232  6e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2221  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.68 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0353826  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0097  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.6 
 
 
393 aa  232  8.000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.89 
 
 
388 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.77 
 
 
382 aa  231  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.89 
 
 
388 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.27 
 
 
382 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.41 
 
 
388 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.41 
 
 
388 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.52 
 
 
389 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2103  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.99 
 
 
388 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32957  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.41 
 
 
388 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.92 
 
 
386 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.12 
 
 
389 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.32 
 
 
387 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  40.32 
 
 
387 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.9 
 
 
389 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  39.25 
 
 
389 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40 
 
 
401 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.12 
 
 
388 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.9 
 
 
392 aa  229  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.63 
 
 
387 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  39.38 
 
 
395 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29740  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.21 
 
 
389 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.26 
 
 
389 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.01 
 
 
390 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.54 
 
 
388 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0504146  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.34 
 
 
389 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  38.62 
 
 
392 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.96 
 
 
391 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1429  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.67 
 
 
388 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.89 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.9 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.72 
 
 
411 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.41 
 
 
388 aa  225  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.67 
 
 
388 aa  225  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2267  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.41 
 
 
388 aa  225  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2812  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.15 
 
 
388 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.01 
 
 
386 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>