More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0043 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
360 aa  714    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65 
 
 
362 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.28 
 
 
362 aa  476  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  64.17 
 
 
362 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.17 
 
 
362 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.97 
 
 
375 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.43 
 
 
381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.19 
 
 
385 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.65 
 
 
382 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.86 
 
 
382 aa  295  7e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.13 
 
 
384 aa  295  9e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.63 
 
 
381 aa  293  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.42 
 
 
384 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.72 
 
 
383 aa  291  9e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.39 
 
 
382 aa  290  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.32 
 
 
379 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.68 
 
 
379 aa  290  3e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.63 
 
 
379 aa  288  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.36 
 
 
385 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.97 
 
 
386 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.96 
 
 
385 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  44.09 
 
 
361 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.71 
 
 
386 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.39 
 
 
378 aa  285  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.65 
 
 
359 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.11 
 
 
387 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.71 
 
 
388 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.92 
 
 
368 aa  280  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.58 
 
 
386 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
387 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.58 
 
 
386 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
382 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.55 
 
 
382 aa  276  5e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.58 
 
 
389 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.67 
 
 
388 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.67 
 
 
388 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.09 
 
 
361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.91 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.58 
 
 
387 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.9 
 
 
377 aa  271  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.52 
 
 
386 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.41 
 
 
388 aa  268  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.29 
 
 
382 aa  268  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.34 
 
 
386 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.12 
 
 
389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  38.26 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.06 
 
 
384 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.82 
 
 
396 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.48 
 
 
386 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.48 
 
 
386 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.48 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1946  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.33 
 
 
360 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152977  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.99 
 
 
385 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.57 
 
 
382 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.38 
 
 
391 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.38 
 
 
392 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.35 
 
 
387 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.41 
 
 
386 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  40.11 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.86 
 
 
410 aa  262  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.27 
 
 
387 aa  261  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.65 
 
 
391 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.62 
 
 
393 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.01 
 
 
387 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.03 
 
 
382 aa  260  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.33 
 
 
391 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.59 
 
 
387 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.46 
 
 
392 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.8 
 
 
387 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.3 
 
 
389 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  38.52 
 
 
390 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.05 
 
 
389 aa  259  7e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.55 
 
 
388 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0148  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.28 
 
 
386 aa  258  8e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0183836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.78 
 
 
393 aa  258  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.02 
 
 
391 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  37.4 
 
 
389 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.44 
 
 
388 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.74 
 
 
388 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
407 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.06 
 
 
387 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  37.2 
 
 
392 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.76 
 
 
389 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.61 
 
 
390 aa  256  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.33 
 
 
387 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.33 
 
 
387 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.01 
 
 
388 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.33 
 
 
387 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.16 
 
 
361 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.690404  normal  0.0268262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.9 
 
 
390 aa  256  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.69 
 
 
405 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  37.98 
 
 
390 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  36.81 
 
 
392 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  37.98 
 
 
390 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>