More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1946 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1946  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
360 aa  724    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152977  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  68.7 
 
 
361 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.35 
 
 
361 aa  463  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.690404  normal  0.0268262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  62.6 
 
 
361 aa  454  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.34 
 
 
359 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.78 
 
 
382 aa  281  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.78 
 
 
382 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.26 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.95 
 
 
379 aa  269  5e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.76 
 
 
377 aa  261  8.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.13 
 
 
360 aa  259  6e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.51 
 
 
375 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.19 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.16 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.04 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.35 
 
 
387 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.38 
 
 
362 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.38 
 
 
362 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.09 
 
 
378 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.42 
 
 
381 aa  249  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.42 
 
 
379 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.18 
 
 
390 aa  243  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  41.32 
 
 
383 aa  242  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.22 
 
 
384 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.89 
 
 
384 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.79 
 
 
386 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.95 
 
 
379 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.47 
 
 
378 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.43 
 
 
384 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.26 
 
 
386 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1582  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.56 
 
 
337 aa  236  4e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0310843  decreased coverage  0.00561469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.95 
 
 
385 aa  235  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.28 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.73 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.36 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.73 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.98 
 
 
382 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  42.08 
 
 
386 aa  232  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.44 
 
 
387 aa  232  9e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.44 
 
 
387 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.28 
 
 
396 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.58 
 
 
382 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.81 
 
 
368 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.57 
 
 
388 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.47 
 
 
382 aa  229  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  38.18 
 
 
393 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.15 
 
 
382 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  37.73 
 
 
392 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  39.28 
 
 
388 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.47 
 
 
401 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.8 
 
 
388 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.15 
 
 
386 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.26 
 
 
388 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.34 
 
 
393 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.8 
 
 
388 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  38.76 
 
 
390 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.05 
 
 
393 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  37.98 
 
 
392 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.9 
 
 
386 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.82 
 
 
389 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.9 
 
 
386 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.03 
 
 
392 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0293  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  39.12 
 
 
337 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  38.5 
 
 
390 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  38.08 
 
 
392 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  38.5 
 
 
390 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.34 
 
 
392 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.28 
 
 
389 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.38 
 
 
385 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.63 
 
 
393 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
385 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.97 
 
 
386 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.22 
 
 
392 aa  222  7e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.95 
 
 
391 aa  222  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.78 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.59 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.99 
 
 
387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.79 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.17 
 
 
392 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.07 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.49 
 
 
382 aa  220  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.07 
 
 
391 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  39.07 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  38.44 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.36 
 
 
386 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.5 
 
 
387 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.88 
 
 
400 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.95 
 
 
389 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0148  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.4 
 
 
386 aa  219  7e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0183836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.63 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.48 
 
 
387 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>