More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5543 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
384 aa  768    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  54.33 
 
 
383 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.35 
 
 
388 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1265  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.57 
 
 
400 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200943  normal  0.595801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
389 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.88 
 
 
388 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.78 
 
 
387 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.78 
 
 
387 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.78 
 
 
387 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.48 
 
 
382 aa  377  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  52.37 
 
 
393 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 
381 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.55 
 
 
389 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.65 
 
 
387 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 
387 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.04 
 
 
389 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.22 
 
 
387 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.16 
 
 
389 aa  364  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.22 
 
 
387 aa  362  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.01 
 
 
400 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.17 
 
 
392 aa  359  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.44 
 
 
382 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.65 
 
 
388 aa  358  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.52 
 
 
393 aa  358  8e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.43 
 
 
411 aa  358  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.39 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.19 
 
 
387 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.68 
 
 
378 aa  356  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.23 
 
 
392 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  50.51 
 
 
390 aa  355  5.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.37 
 
 
393 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.92 
 
 
394 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.74 
 
 
387 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.53 
 
 
382 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52 
 
 
389 aa  349  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.53 
 
 
392 aa  348  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.03 
 
 
389 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.41 
 
 
381 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.59 
 
 
395 aa  346  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.79 
 
 
389 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
392 aa  346  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.64 
 
 
379 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.41 
 
 
391 aa  343  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.77 
 
 
379 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.93 
 
 
389 aa  342  7e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.2 
 
 
387 aa  342  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.96 
 
 
386 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.61 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.4 
 
 
389 aa  338  7e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  338  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.99 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.96 
 
 
386 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.11 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.79 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.97 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  335  9e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.86 
 
 
384 aa  335  9e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  335  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.09 
 
 
385 aa  333  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
386 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.94 
 
 
386 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.93 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.93 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.94 
 
 
387 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
410 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.68 
 
 
387 aa  328  7e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.28 
 
 
382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.27 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.31 
 
 
388 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.09 
 
 
389 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  44.99 
 
 
388 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1397  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.42 
 
 
387 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.45 
 
 
385 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.26 
 
 
399 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.33 
 
 
392 aa  322  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.41 
 
 
385 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0861  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0797  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0208379  normal  0.0728159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0771  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1228  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47 
 
 
388 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0894  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117114  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.64 
 
 
388 aa  320  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.13 
 
 
388 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
388 aa  319  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.56 
 
 
390 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.75 
 
 
397 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.56 
 
 
392 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>