More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0289 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
382 aa  764    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 
378 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.5 
 
 
379 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.12 
 
 
379 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.24 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 
382 aa  387  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.65 
 
 
384 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.7 
 
 
395 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.95 
 
 
387 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.94 
 
 
389 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.08 
 
 
387 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.58 
 
 
387 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.22 
 
 
386 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.2 
 
 
389 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
387 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.79 
 
 
387 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.79 
 
 
389 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  48.79 
 
 
387 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.57 
 
 
392 aa  363  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.05 
 
 
388 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1228  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.92 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.4 
 
 
386 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0797  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0208379  normal  0.0728159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0861  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
388 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.29 
 
 
391 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
388 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0894  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117114  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
388 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0771  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
388 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.01 
 
 
388 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.71 
 
 
389 aa  359  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.44 
 
 
384 aa  359  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.52 
 
 
388 aa  359  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.72 
 
 
391 aa  358  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0647  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
388 aa  358  9e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.26 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.88 
 
 
386 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  47.45 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  48.43 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.48 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.71 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  46.77 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.47 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3098  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47 
 
 
392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1238  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
388 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1146  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 
388 aa  356  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.23 
 
 
388 aa  355  5.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
392 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.48 
 
 
390 aa  354  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.22 
 
 
387 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.56 
 
 
403 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 
386 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.66 
 
 
387 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.04 
 
 
385 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.66 
 
 
378 aa  353  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.61 
 
 
399 aa  352  7e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.04 
 
 
390 aa  352  8e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
386 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.04 
 
 
390 aa  351  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.62 
 
 
385 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.69 
 
 
386 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1157  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.83 
 
 
388 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.74 
 
 
383 aa  350  3e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.76 
 
 
403 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.85 
 
 
387 aa  349  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.15 
 
 
407 aa  348  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.09 
 
 
386 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
388 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.09 
 
 
386 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.7 
 
 
426 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  45.69 
 
 
396 aa  346  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.15 
 
 
392 aa  347  3e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.97 
 
 
405 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.01 
 
 
388 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.05 
 
 
409 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  45.19 
 
 
388 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.19 
 
 
388 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>